Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms