Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms