Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms