Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms