Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms