Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms