Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms