Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIBP1Q86W92 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms