Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms