Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RSBN1Q5VWQ0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RSBN1Q5VWQ0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RSBN1Q5VWQ0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RSBN1Q5VWQ0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms