Protein–RNA interactions for Protein: Q5MIZ7

PPP4R3B, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3B, humanhuman

Predictions only

Length 849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R3BQ5MIZ7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP4R3BQ5MIZ7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP4R3BQ5MIZ7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP4R3BQ5MIZ7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP4R3BQ5MIZ7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP4R3BQ5MIZ7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPP4R3BQ5MIZ7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPP4R3BQ5MIZ7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPP4R3BQ5MIZ7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPP4R3BQ5MIZ7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4R3BQ5MIZ7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms