Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms