Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7S5

SMIM21, Small integral membrane protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM21Q3B7S5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM21Q3B7S5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms