Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TWISTNBQ3B726 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms