Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
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