Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q1T7F1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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