Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FXNQ16595 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FXNQ16595 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FXNQ16595 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FXNQ16595 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FXNQ16595 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FXNQ16595 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FXNQ16595 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FXNQ16595 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FXNQ16595 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FXNQ16595 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FXNQ16595 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FXNQ16595 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FXNQ16595 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FXNQ16595 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FXNQ16595 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FXNQ16595 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FXNQ16595 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FXNQ16595 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FXNQ16595 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FXNQ16595 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FXNQ16595 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FXNQ16595 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FXNQ16595 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FXNQ16595 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FXNQ16595 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FXNQ16595 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FXNQ16595 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FXNQ16595 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FXNQ16595 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FXNQ16595 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FXNQ16595 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FXNQ16595 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FXNQ16595 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FXNQ16595 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FXNQ16595 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FXNQ16595 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FXNQ16595 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FXNQ16595 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FXNQ16595 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FXNQ16595 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FXNQ16595 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FXNQ16595 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FXNQ16595 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FXNQ16595 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FXNQ16595 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FXNQ16595 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FXNQ16595 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FXNQ16595 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FXNQ16595 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FXNQ16595 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FXNQ16595 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FXNQ16595 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FXNQ16595 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FXNQ16595 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FXNQ16595 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FXNQ16595 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FXNQ16595 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FXNQ16595 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FXNQ16595 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FXNQ16595 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FXNQ16595 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FXNQ16595 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FXNQ16595 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FXNQ16595 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FXNQ16595 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FXNQ16595 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FXNQ16595 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FXNQ16595 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FXNQ16595 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FXNQ16595 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FXNQ16595 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FXNQ16595 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FXNQ16595 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FXNQ16595 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FXNQ16595 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FXNQ16595 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FXNQ16595 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FXNQ16595 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FXNQ16595 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FXNQ16595 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FXNQ16595 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FXNQ16595 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FXNQ16595 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FXNQ16595 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FXNQ16595 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FXNQ16595 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FXNQ16595 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FXNQ16595 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FXNQ16595 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FXNQ16595 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FXNQ16595 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FXNQ16595 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FXNQ16595 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FXNQ16595 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FXNQ16595 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FXNQ16595 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FXNQ16595 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FXNQ16595 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FXNQ16595 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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