Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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TNXAQ16473 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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TNXAQ16473 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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TNXAQ16473 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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TNXAQ16473 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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TNXAQ16473 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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TNXAQ16473 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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TNXAQ16473 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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TNXAQ16473 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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TNXAQ16473 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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TNXAQ16473 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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TNXAQ16473 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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