Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF3A1Q15459 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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