Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
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SYCP1Q15431 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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SYCP1Q15431 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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SYCP1Q15431 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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SYCP1Q15431 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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SYCP1Q15431 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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