Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
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