Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNIP1Q15025 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNIP1Q15025 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms