Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB39AQ14964 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB39AQ14964 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB39AQ14964 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB39AQ14964 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB39AQ14964 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB39AQ14964 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB39AQ14964 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB39AQ14964 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB39AQ14964 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB39AQ14964 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB39AQ14964 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB39AQ14964 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB39AQ14964 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB39AQ14964 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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RAB39AQ14964 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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RAB39AQ14964 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB39AQ14964 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB39AQ14964 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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RAB39AQ14964 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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RAB39AQ14964 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB39AQ14964 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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RAB39AQ14964 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB39AQ14964 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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RAB39AQ14964 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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RAB39AQ14964 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB39AQ14964 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB39AQ14964 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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RAB39AQ14964 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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