Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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