Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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SPIDRQ14159 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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SPIDRQ14159 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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SPIDRQ14159 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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