Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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CKAP5Q14008 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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