Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms