Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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