Protein–RNA interactions for Protein: Q13569

TDG, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDGQ13569 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDGQ13569 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDGQ13569 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDGQ13569 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDGQ13569 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDGQ13569 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDGQ13569 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDGQ13569 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDGQ13569 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TDGQ13569 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDGQ13569 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDGQ13569 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDGQ13569 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDGQ13569 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDGQ13569 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDGQ13569 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDGQ13569 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDGQ13569 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDGQ13569 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDGQ13569 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TDGQ13569 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDGQ13569 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDGQ13569 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDGQ13569 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDGQ13569 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDGQ13569 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TDGQ13569 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDGQ13569 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDGQ13569 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDGQ13569 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TDGQ13569 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TDGQ13569 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TDGQ13569 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDGQ13569 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDGQ13569 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDGQ13569 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDGQ13569 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDGQ13569 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDGQ13569 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDGQ13569 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TDGQ13569 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDGQ13569 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TDGQ13569 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDGQ13569 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDGQ13569 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDGQ13569 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDGQ13569 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDGQ13569 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TDGQ13569 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDGQ13569 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDGQ13569 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDGQ13569 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDGQ13569 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDGQ13569 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDGQ13569 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDGQ13569 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TDGQ13569 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TDGQ13569 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TDGQ13569 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TDGQ13569 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TDGQ13569 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms