Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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