Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms