Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms