Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
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SEMA3BQ13214 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
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SEMA3BQ13214 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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