Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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FOXD4Q12950 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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FOXD4Q12950 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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