Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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CNTN1Q12860 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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CNTN1Q12860 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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