Protein–RNA interactions for Protein: Q07157

TJP1, Tight junction protein ZO-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TJP1Q07157 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TJP1Q07157 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
TJP1Q07157 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TJP1Q07157 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TJP1Q07157 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TJP1Q07157 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TJP1Q07157 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TJP1Q07157 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TJP1Q07157 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TJP1Q07157 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TJP1Q07157 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TJP1Q07157 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TJP1Q07157 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TJP1Q07157 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TJP1Q07157 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TJP1Q07157 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TJP1Q07157 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TJP1Q07157 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TJP1Q07157 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TJP1Q07157 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TJP1Q07157 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TJP1Q07157 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms