Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR3Q06889 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms