Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms