Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
UBXN1Q04323 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms