Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAV1Q03135 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAV1Q03135 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAV1Q03135 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAV1Q03135 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAV1Q03135 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAV1Q03135 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAV1Q03135 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CAV1Q03135 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CAV1Q03135 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CAV1Q03135 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CAV1Q03135 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CAV1Q03135 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CAV1Q03135 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAV1Q03135 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms