Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AL138729.1-201ENST00000406666 664 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 AC116348.1-201ENST00000562525 528 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 HACL1-206ENST00000435217 1269 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 AC007570.1-201ENST00000539987 603 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 GBA3-207ENST00000613293 1233 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms