Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDR2Q01850 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms