Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms