Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBP60709 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBP60709 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBP60709 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTBP60709 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTBP60709 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTBP60709 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTBP60709 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTBP60709 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTBP60709 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTBP60709 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTBP60709 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTBP60709 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTBP60709 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTBP60709 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTBP60709 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTBP60709 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTBP60709 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTBP60709 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTBP60709 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTBP60709 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTBP60709 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTBP60709 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTBP60709 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTBP60709 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTBP60709 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTBP60709 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTBP60709 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTBP60709 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTBP60709 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTBP60709 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTBP60709 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTBP60709 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTBP60709 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTBP60709 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTBP60709 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTBP60709 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTBP60709 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTBP60709 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTBP60709 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTBP60709 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTBP60709 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms