Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF3P57682 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF3P57682 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF3P57682 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF3P57682 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF3P57682 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF3P57682 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF3P57682 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF3P57682 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF3P57682 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF3P57682 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF3P57682 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF3P57682 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF3P57682 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF3P57682 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF3P57682 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF3P57682 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF3P57682 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF3P57682 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF3P57682 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF3P57682 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF3P57682 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF3P57682 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF3P57682 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF3P57682 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF3P57682 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF3P57682 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF3P57682 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF3P57682 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF3P57682 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF3P57682 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF3P57682 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF3P57682 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF3P57682 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF3P57682 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF3P57682 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF3P57682 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF3P57682 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF3P57682 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF3P57682 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF3P57682 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF3P57682 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF3P57682 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF3P57682 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF3P57682 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF3P57682 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF3P57682 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF3P57682 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF3P57682 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF3P57682 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF3P57682 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF3P57682 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF3P57682 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF3P57682 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF3P57682 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF3P57682 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF3P57682 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF3P57682 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF3P57682 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF3P57682 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF3P57682 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF3P57682 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF3P57682 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF3P57682 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF3P57682 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF3P57682 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF3P57682 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF3P57682 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF3P57682 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF3P57682 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF3P57682 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF3P57682 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF3P57682 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF3P57682 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF3P57682 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF3P57682 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF3P57682 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF3P57682 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF3P57682 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF3P57682 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF3P57682 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF3P57682 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF3P57682 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF3P57682 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF3P57682 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF3P57682 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF3P57682 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF3P57682 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF3P57682 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF3P57682 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF3P57682 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF3P57682 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF3P57682 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF3P57682 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF3P57682 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF3P57682 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF3P57682 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF3P57682 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF3P57682 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF3P57682 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms