Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms