Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NME5P56597 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME5P56597 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NME5P56597 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME5P56597 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME5P56597 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME5P56597 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME5P56597 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME5P56597 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME5P56597 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME5P56597 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME5P56597 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME5P56597 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME5P56597 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME5P56597 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NME5P56597 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NME5P56597 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NME5P56597 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NME5P56597 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME5P56597 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME5P56597 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME5P56597 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME5P56597 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME5P56597 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NME5P56597 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME5P56597 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME5P56597 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME5P56597 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME5P56597 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NME5P56597 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME5P56597 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME5P56597 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME5P56597 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME5P56597 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME5P56597 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME5P56597 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME5P56597 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME5P56597 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME5P56597 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME5P56597 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME5P56597 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME5P56597 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME5P56597 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME5P56597 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME5P56597 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME5P56597 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME5P56597 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME5P56597 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NME5P56597 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME5P56597 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME5P56597 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME5P56597 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME5P56597 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME5P56597 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME5P56597 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME5P56597 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME5P56597 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME5P56597 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NME5P56597 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME5P56597 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME5P56597 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NME5P56597 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME5P56597 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NME5P56597 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME5P56597 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME5P56597 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME5P56597 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME5P56597 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME5P56597 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME5P56597 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME5P56597 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME5P56597 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME5P56597 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME5P56597 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME5P56597 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME5P56597 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME5P56597 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME5P56597 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME5P56597 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME5P56597 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME5P56597 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME5P56597 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME5P56597 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME5P56597 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME5P56597 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME5P56597 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME5P56597 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME5P56597 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NME5P56597 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NME5P56597 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME5P56597 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME5P56597 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME5P56597 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME5P56597 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME5P56597 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME5P56597 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME5P56597 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME5P56597 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME5P56597 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME5P56597 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 576 ms