Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms