Protein–RNA interactions for Protein: P56381

ATP5E, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5EP56381 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ATP5EP56381 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms