Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms